杜梨叶片转录组分析

作者：陈燕; 郭聪; 王莹; 李玉娟^*

来源：江苏农业科学, 2022, 50(03): 58-67.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2022.03.009

• 杜梨
• 叶色
• 转录组测序
• 功能注释
• 单核苷酸多态性

杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)抗逆性强，叶色随季节变化而改变，被广泛用于沿海滩涂景观改造，是园林绿化中常用树种。为了解杜梨色叶相关基因调控途径，对杜梨叶片进行转录组测序，共获得67.7 Gb测序数据，通过组装共得到60 611个基因，其中包含1 059个新基因；与8个功能数据库进行比对分析，共57 669个基因得到了功能注释，注释效率为95.15%;GO分析发现，已注释的差异表达基因共涉及49个功能组，主要集中在膜(细胞组分)、催化活性(分子功能)、代谢过程(生物学过程)等中；KEGG分析发现，差异表达基因主要富集在碳代谢和植物-病原体相互作用等生物学过程中；共筛选出10个与类黄酮相关的基因，分别属于UDPGT等6个基因家族；在杜梨叶片转录组中共筛选出452 501个SNP位点，碱基转换类型所占比例远远高于颠换类型，表明杜梨具有丰富的SNP位点信息。本研究结果可为探究杜梨色叶分子机制等提供理论依据。

• 单位
  江苏沿江地区农业科学研究所