工程教育专业认证具有完整的理论体系、培养理念和评价标准,高等学校积极开展专业的认证工作能够推进教学改革。在工程教育专业认证的背景和要求下,从微生物学课程角度介绍了课程目标、教学过程、课程质量评价和解决复杂工程问题能力培养等方面的注意事项与教学改革探索,提出了一些观点和建议。