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摘要
目的 基于分子对接的虚拟筛选和体外抑菌实验快速筛选出DNA拓扑异构酶Ⅳ抑制剂。方法 采用AutoDock Vina程序对DNA拓扑异构酶Ⅳ的3个靶点蛋白1S16、3FV5和4ZH0进行方法学研究，通过均方根偏差(RMSD)、曲线下面积(AUC)、富集因子(EF)等参数评估对活性分子富集能力较强的分子对接模型，并利用该模型对数据库进行大规模的虚拟筛选，保留结合能低于阈值的化合物开展体外抑菌实验。结果 综合回溯性验证结果发现1S16靶点蛋白的分子对接模型具有较强的活性分子富集能力，基于该模型虚拟筛选出22个具有潜在抑菌活性的化合物，体外抑菌实验发现其中8个化合物具有明显的抗大肠杆菌活性。结论 本研究发现8个化合物具有明确的抗大肠杆菌活性，有望成为新型DNA拓扑异构酶Ⅳ抑制剂。
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单位重庆市药物种植研究所; 化学化工学院; 重庆科技学院
