细粒棘球绦虫表面抗原MKK1的生物信息学分析

作者：路鹏霏; 田梦潇; 吴川川; 李军; 张文宝; 毛睿; 齐**^*

来源：中国病原生物学杂志, 2023, 18(04): 406-410.

DOI：10.13350/j.cjpb.230407

• 细粒棘球绦虫
• EgMKK1
• 生物信息学
• 抗原性

目的 运用生物信息预测网站及相关工具分析细粒棘球绦虫表面抗原MKK1的理化性质、抗原性等。方法 EgMKK1氨基酸序列经NCBI数据库中下载，采用ProtParam分析蛋白的理化性质，SignalP-5分析信号肽，Euk-mPLoc 2.0进行亚细胞定位，ProtScale、SOSUI及DNASTAR分析亲疏水性，SOMPA分析二级结构，NetPhos分析磷酸化位点，MotifScan分析修饰位点，Swissmodel分析三级结构，TMHMM分析跨膜区域，ABCpred和IEDB预测B细胞抗原表位，SYFPEITHI预测T细胞抗原表位。结果 EgMKK1由338氨基酸序列组成，分子式为C1688H2687N471O497S17,亲水指数为-0.167456,为亲水蛋白；无信号肽，含2个跨膜区，且定位于细胞质及细胞核中。二级结构中α螺旋占43.20%,β折叠占10.95%,β转角占4.14%,无规则卷曲占41.72%。EgMKK1能与HLA-A*02-01结合，且能被HLA-DRB*0401(DR4Dw4)分子呈递。结论 生物信息学预测EgMKK1为亲水性蛋白，含有丰富的T、B细胞抗原表位，可为该蛋白的生物学功能研究及细粒棘球蚴病的防治研究提供参考。

• 单位
  基础医学院; 新疆医科大学; 新疆医科大学第一附属医院