瓣膜宏基因二代测序在感染性心内膜炎病原学诊断中的应用

作者：蔡思诗; 杨晔; 潘珏; 缪青; 黄英男; 王青青; 马玉燕; 金文婷; 高晓东; 鲍容; 单玉璋; 胡必杰^*; 王春生^*

来源：中华医院感染学杂志, 2020, 30(22): 3404-3408.

• 宏基因二代测序
• 感染性心内膜炎
• 病原学诊断

目的探讨瓣膜宏基因二代测序(mNGS)在感染性心内膜炎(IE)病原学诊断中的临床应用价值。方法回顾性分析从2018年6月21日-2020年6月18日在复旦大学附属中山医院确诊为IE并行心脏瓣膜手术的30例患者(18例患者培养阳性,12例患者培养阴性)。对于培养阳性IE患者,以培养结果为金标准,研究瓣膜mNGS检测病原体的可靠性。对于培养阴性IE患者,研究瓣膜mNGS的病原体检出率。比较培养阳性IE患者和培养阴性IE患者瓣膜mNGS检出病原体属相对丰度、属严格序列数、覆盖率、种相对丰度以及种严格序列数差异。结果培养阳性IE患者,瓣膜mNGS结果同培养结果完全一致,敏感度和特异度均为100%。对培养阴性IE患者,瓣膜mNGS检出病原体阳性率为100%。培养阳性IE患者瓣膜mNGS检出病原体的属严格序列数、覆盖率、种相对丰度以及种严格序列数均高于培养阴性IE患者,两组患者瓣膜mNGS检出病原体的属相对丰度无显著差异。结论瓣膜mNGS诊断IE病原体的敏感度、可靠性高,为培养阴性IE患者明确病原体、精准化抗感染用药提供了新的途径。

• 单位
  复旦大学附属中山医院