鸡NLRs基因家族鉴定、系统进化及表达分析

作者：孟婕; 张贝; 杨晴; 李可强; 张传生; 耿立英^*; 李祥龙

来源：中国家禽, 2022, 44(03): 1-8.

DOI：10.16372/j.issn.1004-6364.2022.03.001

• 鸡
• NLRs基因家族
• 进化分析
• 基因表达

为深入了解鸡NOD样受体（NLRs）家族基因特性，利用生物信息学方法通过保守结构域搜索鉴定了鸡的NLRs基因，分析NLRs基因理化性质、基因结构、系统进化关系、正选择作用、共线性关系和表达情况。结果显示：共鉴定出5个鸡NLRs基因，分别命名为chNLRC5、chNLRC3、chNLRP3、chNLRX1、chNOD1，分布在5条染色体上，编码734～1 862个氨基酸，编码蛋白相对分子质量为82 842.01～207 969.52 ku，等电点为5.48～8.64;chNLRC5、chNOD1和chNLRP3为酸性蛋白，chNLRC3和chNLRX1蛋白呈碱性，只有chNOD1为稳定蛋白，5个成员均为亲水蛋白，5个基因结构差别显著，分别含有48、20、7、7、11个外显子；系统进化树显示，NLRs基因家族分为5个分支，鸡、绿头鸭、火鸡和日本鹌鹑NLR基因间存在较强的共线性关系；对各成员进行选择压力分析结果鉴定出13个正选择位点；鸡回肠和肺组织中检测到NLR基因表达。研究表明正选择效应在NLRX1、NOD1、NLRC5基因作用明显，NLRC5在鸡回肠和肺组织中为表达活跃的功能基因。

• 单位
  河北科技师范学院