绒山羊4个多胎性状候选基因多态性及其与产羔数的关联分析

作者：萨初拉; 吴铁成; 马跃军; 何云梅; 朱莉仙; 何托雅; 武玉平; 刘斌^*

来源：中国畜牧兽医, 2023, 50(03): 1037-1047.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2023.03.019

• 绒山羊
• GDF9基因
• BMP15基因
• BMPR1B基因
• B4GALNT2基因
• 产羔数

【目的】通过对内蒙古白绒山羊4个多胎性状相关基因进行测序和生物信息学分析，深入挖掘与产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphisms, SNP)位点，为提升绒山羊高效繁育提供理论依据。【方法】选取阿拉善型、阿尔巴斯型绒山羊母羊244只，利用MultipSeq多重PCR结合二代高通量技术检测生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)、骨形态发生蛋白15 (bone morphogenetic protein 15,BMP15)、骨形态发生蛋白受体1B(bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B)和β-1,4-N-乙酰氨基半乳糖转移酶2 (beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2,B4GALNT2)基因多态性，并对不同SNP位点与绒山羊产羔数进行关联分析。【结果】通过GATK分析共预测得到172个SNPs位点，其中BMPR1B、B4GALNT2、BMP15、GDF9基因相关SNPs位点分别为95、33、26和18个。GLM模型关联分析发现，10个SNPs位点与白绒山羊产羔数显著相关(P<0.05),进一步进行卡方检验发现，其中7个SNPs位点基因型与产羔数显著相关(P<0.05)。BMPR1B基因g.29893723 C>G、g.29897064 G>A、g.29897722 G>A、g.29897734 C>A和g.29938673 C>G位点的CC、GG、GA、CA和CC基因型个体产羔数分别显著高于CG、GA、GG、CC和GG基因型(P<0.05);B4GALNT2基因g.37072289 G>A位点的GG和GA基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(P<0.05);GDF9基因g.66027842 A>C位点的CC和AC基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(P<0.05)。【结论】试验获得了内蒙古白绒山羊多胎性状相关基因GDF9、BMP15、BMPR1B和B4GALNT2的SNPs位点序列特征，发现了与白绒山羊产羔数显著相关的10个SNPs位点，并揭示了不同基因型产羔数间的差异，从而为内蒙古白绒山羊分子辅助育种提供了有力的SNP参考位点。

• 单位
  内蒙古自治区农牧业科学院