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摘要
【目的】对育成期高能饲喂下开产与未开产蛋鸡的肝脏进行miRNA高通量测序分析，探明高能饮食状态下蛋鸡肝脏中影响其开产的miRNA，为提高产蛋性能打下基础。【方法】以代谢能水平为12.14 MJ/kg的高能饲粮饲喂育成期蛋鸡，通过Illumina NextSeq500高通量测序平台对开产与未开产蛋鸡肝脏进行small RNA测序，使用DESeq分析miRNA表达量，并以实时荧光定量PCR进行验证；采用miRanda对差异表达miRNA进行靶基因和靶位点预测，同时以超几何分布对差异表达的靶基因进行GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析。【结果】6个样本（3个开产蛋鸡样本，3个未开产蛋鸡样本）能注释到的miRNA均超过300个，约占miRBase中已鉴定鸡miRNA的30.00%，且前体鉴定结果显示各样本注释到的miRNA有部分定位在同一前体上。与未开产组样本相比，开产组样本有9个miRNA表达上调、3个miRNA表达下调。其中，gga-miR-132c-5p、gga-miR-132b-5p、gga-miR-2184a-5p、gga-miR-132c-3p、gga-miR-132b-3p及gga-miR-2184a-3p属于同一miRNA基因簇，且gga-miR-1682、gga-miR-132b-3p和gga-miR-2184a-3p等3个上调miRNA在未开产蛋鸡样本中不表达。通过miRanda共预测得到129个差异表达潜在靶基因，以miR-203a预测得到的靶基因最多，为32个；其次是gga-miR-2184a-5p、gga-miR-148a-5p和gga-miR-12211-5p，分别预测到30、25和23个靶基因；而miR-132c-5p预测得到的靶基因最少，仅为9个。129个靶基因显著注释到8条GO功能条目上，生物学过程（Biological process）主要注释到脂质代谢过程、细胞脂质代谢过程、脂质生物合成过程、磷脂生物合成过程、磷脂代谢过程、甘油磷脂生物合成过程和解剖学结构发育，分子功能（Molecular funcion）仅注释到1条GO功能条目，即利钠肽受体活性，未发现涉及细胞组分（Cellular component）的GO功能条目；在注释到的8条GO功能条目中有6条与脂质代谢相关，涉及的靶基因有22个，占总潜在靶基因的17.10%。KEGG信号通路富集分析结果显示共显著富集到7条KEGG信号通路，其中脂肪酸降解、脂肪酸生物合成、酮体合成与降解及PPAR信号通路等4条信号通路与脂质代谢相关。【结论】育成期高能饲喂下开产与未开产蛋鸡中共存在12个差异表达miRNA，涉及129个差异表达潜在靶基因，且主要富集在肝脏脂质代谢相关过程和信号通路，说明miRNA是通过调控脂质代谢及其相关基因表达而影响蛋鸡开产。
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