绵羊ERβ基因的生物信息学分析

作者：王晨; 杨娟; 袁肇方; 张雪婷; 魏锁成^*

来源：西北民族大学学报(自然科学版), 2020, 41(01): 33-40.

DOI：10.14084/j.cnki.cn62-1188/n.2020.01.007

• 雌激素受体
• ESR2
• ERβ
• 绵羊
• 生物信息学

目的:深入探明绵羊ERβ基因结构及其他结构与功能。方法:基于GenBank数据库中绵羊ERβ基因蛋白质编码区(CDS)区序列,利用ORFfinder、ProtParam、BioEdit、SignalP、PSORT Ⅱ、PredictProtein和SWISS MODEL等工具分析预测ERβ基因编码蛋白的结构、性质、功能及信号通路等,应用NCBI-BLAST、MEGA-X进行基因序列比对,并构建系统进化树。结果:绵羊ERβ基因CDS区共编码527个氨基酸,ERβ基因编码的产物呈疏水性,无信号肽与跨膜结构域。二级结构以α螺旋和无规卷曲为主,三级结构以α-螺旋结构单元为主。ERβ基因主要在细胞核和细胞质发挥生物学作用,这与G蛋白偶联受体活性有密切相关作用。结论:ERβ基因参与多个生殖和肿瘤相关的信号通路。

• 单位
  西北民族大学