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摘要
为了研究慈姑球茎发育过程中转录组功能基因表达情况，本研究对其不同时期进行转录组测序，获得表达基因信息，以探讨球茎发育相关基因的表达特征及淀粉合成代谢相关调控。结果显示，慈姑球茎测序组装后共获得63.53 Gb的Clean Reads，总共获得60 884个Unigene，平均长度为897.34 bp,N50为1.368 kb。使用五个公共数据库成功注释了总共36 590个Unigene。组装完整性较高，效果好。差异表达基因分析表明，慈姑匍匐茎膨大为球茎初期，差异基因最多，表现最为活跃。GO (Gene ontology)功能富集中，21 453个基因获得功能注释，分为分子功能、细胞组分和生物学过程3大类和54个亚类。COG (Clusters of orthologous groups)功能分类中，13 653个基因分布于25个功能区域，其中碳水化合物代谢占重要地位。KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)代谢通路注释中，14 226个基因获得功能注释，共有118条代谢途径，其中淀粉-蔗糖代谢占主要作用。本研究首次建立了丰富的慈姑球茎的转录组数据库，对进一步深化解析慈姑球茎淀粉生物合成的分子机制提供数据基础。
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