口腔鳞状细胞癌m6A相关差异表达基因的生物信息学分析

作者：徐莉; 南茜

来源：重庆医科大学学报, 2022, 47(01): 92-96.

DOI：10.13406/j.cnki.cyxb.002652

• 口腔鳞状细胞癌
• 差异表达基因
• 6A甲基化" name="keyword">m6A甲基化
• 生物信息学

目的:筛选口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)m6A相关的差异表达基因,探寻相关信号通路,为OSCC提供候选的诊断标记物和分子治疗靶点。方法:下载TCGA数据库中OSCC数据,提取m6A相关基因的表达。R软件筛选正常组织和肿瘤组织间的差异表达基因,对m6A相关基因进行聚类分析与相关性分析。基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)研究差异基因的信号通路。结果:本研究筛选出8个差异表达基因(P<0.05),包括HNRNPC、KIAA1429、METTL3、METTL14、RBM15、WTAP、YTHDF1和YTHDF2,差异基因在癌组织的表达量均高于正常组织(P<0.05)。m6A相关基因之间存在复杂的相关性。GSEA富集分析显示,差异表达基因主要参与细胞周期、碱基切除修复、同源重组和剪接体等相关信号通路。结论:HNRNPC、KIAA1429、METTL3、METTL14、RBM15、WTAP、YTHDF1与YTHDF2可作为OSCC的候选诊断标记物和分子治疗靶点。

• 单位
  华中科技大学同济医学院附属同济医院