基因表达连续分析标签数据库的实时定量多聚酶链反应验证

作者：尹磊淼; 张庆华; 王宇; 徐玉东; 杨永清

来源：中国医学科学院学报, 2010, (01): 51-54.

DOI：10.3881/j.issn.1000-503X.2010.01.013

• 基因表达连续分析
• 实时定量多聚酶链反应 serial analysis of gene expression
• real-time polymerase chain reaction

目的采用实时定量多聚酶链反应(PCR)技术验证不同丰度和匹配度的基因表达序列标签,尝试用该技术补充和完善高通量基因表达谱的结果。方法根据各基因序列全长设计引物,选择9个单匹配标签,6个多匹配标签,1个美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库更新后无匹配标签和2个无匹配基因进行实时定量PCR验证。结果挑选的所有基因均得到特异性扩增。基因表达量分析结果显示,基因表达连续分析(SAGE)文库中9个单匹配标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;6个多匹配标签中有3个标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;1个NCBI数据库更新后无匹配标签表达趋势和定量结果相反;2个无匹配基因表达量数据提...

• 单位
  生物芯片上海国家工程研究中心; 上海中医药大学; 上海市针灸经络研究所