水稻抗白叶枯病基因Xa47(t)a的克隆及生物信息学分析

作者：卢源达; 张敦宇; 钟巧芳; 王波; 殷富有; 程在全; 杜云龙; 陈玲

来源：分子植物育种, 2023, 1-15.

• 野生稻
• Xa47(t)a
• 基因克隆
• 生物信息学分析
• 诱导表达

Xa47(t)是一个新的抗白叶枯病基因，其供体材料来自元江普通野生稻(O. rufipogon Yuanjiang Type， CWR)渗入系(LR)。在Xa47(t)基因进行分离过程中发现Xa47(t)存在不同基因型，其中A基因型在LR材料中存在较为广泛。本研究选取8份多年田间追踪调查未感白叶枯病的渗入系材料进行多菌系鉴定，并对A基因型进行生物信息学分析，包括氨基酸组成、理化性质、蛋白结构预测、亚细胞定位的预测，也对A基因型在不同组织部位的表达、接菌诱导表达、病程相关基因表达进行检测。抗性鉴定结果表明，8份渗入系广谱高抗白叶枯病，尤其是L214对供试菌株抗性最好病斑长度介于(0.00±0.00)～(3.50±1.50) cm。基因克隆及生物信息分析结果表明，Xa47(t)a基因的全长为4998 bp，3个外显子、2个内含子，CDS全长2340 bp，编码802个氨基酸的NLR类蛋白，该蛋白可与ATP结合。RT-qPCR结果显示，Xa47(t)a基因在不同组织部位均有表达，也可受到病原菌的诱导表达，其病程相关基因(OsWRKY19， OsWRKY45， OsNPR1， OsPR1a， OsPR10)受到病原菌的诱导也均上调表达。综上可知，Xa47(t)a是一个较为重要的抗白叶枯病基因资源，8份供试材料也是水稻抗白叶枯病育种的宝贵种质资源。

• 单位
  云南农业大学; 农业部; 云南省农业生物技术重点实验室; 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所