添加能量和倾向性因子识别蛋白质——金属离子配体结合残基

作者：杨彩芸; 胡秀珍^*; 尤肖肖; 王子洋; 郝四喜; 胡慧敏

来源：内蒙古工业大学学报(自然科学版), 2022, 41(02): 105-114.

DOI：10.13785/j.cnki.nmggydxxbzrkxb.2022.02.001

• 能量
• 倾向性因子
• 支持向量机(SVM)算法
• 金属离子配体

金属离子作为一种重要的配体与蛋白质结合在细胞代谢、物质运输和信号传导等过程中发挥着重要作用。因此，理论上准确识别蛋白质与金属离子配体结合残基有十分重要的意义。选取10种金属离子配体作为研究对象，以氨基酸、氨基酸的物化特征和预测的结构信息作为基础特征参数，添加能量和倾向性因子两种新的预测参数，使用支持向量机(SVM)算法对蛋白质-金属离子配体结合残基进行预测，五交叉检验和独立检验都得到了较好的预测结果，独立检验下Fe2+、Fe3+、Co2+和K+得到了好于前人的预测结果。

• 单位
  内蒙古工业大学