家族性孤独症家系中先证者与无症状同胞的全外显子组测序结果的比较分析

作者:郑天津; 李潘苑; 王珏; 骆美辰; 林颖; 宾淑芳; 叶娟娟; 张静; 孙博浩*
来源:中国优生与遗传杂志, 2022, 30(03): 411-416.
DOI:10.13404/j.cnki.cjbhh.20220224.011

摘要

目的 本研究旨在为家族性孤独症的风险基因提供更多依据,进而可以为家族性孤独症家系中再生风险的产前诊断提供参考。方法 对1个家族性孤独症家系中先证者、无症状同胞及其父母进行全外显子组测序,自行设置合理条件对突变的注释进行初步筛选,Sanger测序验证突变,进一步自行选用合理指标筛选孤独症相关基因,比较先证者与无症状同胞的结果。结果 先证者Ⅳ1的所有变异中,突变有害性为高级的,且突变质量值为高度和中度的,且在HGMD数据库中涉及孤独症的,共包括21个初筛基因突变。进一步根据孤独症数据库中基因收录证据分值,AutKB中大于4分或AutDB中至少3分,筛选出候选孤独症相关基因共包括11个。这11个候选相关基因中,AutKB孤独症数据库中基因收录证据分值大于16分的是高可信的孤独症相关基因,包括LAMC3、JMJD1C、CACNA1H这3个。这3个基因的具体错义突变位点均是本研究首次报道的。除LAMC3、JMJD1C遗传于有孤独症家族史的父方Ⅲ1,还有无家族史的母方Ⅲ2来源基因CACNA1H的累加作用。无症状同胞不是无突变,先证者Ⅳ1因为突变基因较无症状同胞Ⅳ2多2个(LAMC3、JMJD1C)而发病。该先证者的父亲Ⅲ1与母亲Ⅲ2如果再生育,则产前基因诊断应该至少检测这3个高可信的孤独症相关基因。结论 该研究自行建立了从全外显子组测序结果中筛选高可信的孤独症相关基因的合理、可行方法,具有实际推广应用价值。该家系先证者的高可信的孤独症相关基因是LAMC3、JMJD1C、CACNA1H。可以为再生风险的产前诊断提供参考。

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