鹑鸡肠球菌对万古霉素耐药性监测及耐药基因研究

作者：谢晖; 周万青; 沈瀚^*

来源：东南国防医药, 2021, 23(03): 249-252.

DOI：10.3969/j.issn.1672?271X.2021.03.006

• 鹑鸡肠球菌
• 万古霉素耐药
• vanA基因
• 全基因组测序

目的调查临床分离鹑鸡肠球菌对万古霉素的耐药情况及耐药机制。方法采用VITEK 2系统GP67卡对2019年1-12月南京大学医学院附属鼓楼医院临床分离15株鹑鸡肠球菌进行药敏试验,采用E-test法复核菌株对万古霉素最低抑菌浓度(MIC);采用PCR及测序技术分析万古霉素耐药决定基因vanA、vanB、vanC1及vanC2/3;采用Illumina HiSeq 2000测序技术对菌株基因组DNA进行双端测序(PE),利用生物信息学对菌株全基因组序列分析及耐药基因、毒力基因分析。结果 15株鹑鸡肠球菌对万古霉素的MIC值集中在4 mg/L和8 mg/L,所占比例分别为40%和33.3%,检出1株(6%)万古霉素高水平耐药株EG17906(MIC为256 mg/L),该菌株除对万古霉素和替考拉宁耐药外,对其余常用抗生素均敏感;15株菌株均检出vanC1基因,EG17906菌株同时检出vanA基因;EG17906菌株经全基因组测序分析,基因组大小为3765 197 bp,鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比率GC含量为40.4%,总基因数为3754,基因组含有3592个编码序列,60个tRNA编码基因以及10个完整的rRNA基因编码操纵子。耐药基因预测分析该菌株携带VanC1XY、VanHAX、erm(A)、erm(A)、tet(O)、cat(pC221)。全基因序列提交至美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库,GeneBank号为JABMDB000000000。结论鹑鸡肠球菌携带vanC1对万古霉素呈低水平耐药,而同时携带vanA基因可造成菌株高水平耐药,需引起重视。

• 单位
  南京大学医学院附属鼓楼医院