转录组测序揭示不同生长速度番鸭胸肌组织的基因表达差异

作者：张思雨; 朱炜健; 季从亮; 郭利金; 郑茗; 徐海平; 聂庆华^*

来源：广东农业科学, 2020, 47(10): 132-139.

DOI：10.16768/j.issn.1004-874X.2020.10.017

• 番鸭
• 转录组
• 生长性状
• 磷脂酰肌醇三激酶-丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-AKT)
• 丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)
• 腺苷酸激活蛋白激酶(AMPK)

【目的】利用转录组测序技术分析不同生长速度番鸭的基因表达差异,挖掘影响番鸭生长性能的基因与信号通路,为阐明生长性能差异的遗传机制提供理论基础。【方法】选取不同生长速度两尾样番鸭的胸肌组织进行转录组测序,采用无参考基因组的分析手段对测序结果进行分析,获得差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。利用Blast2 GO软件对DEGs进行功能富集分析,利用KAAS网站进行DEGs的通路富集分析。【结果】转录组测序分析结果显示,快速生长型番鸭与缓慢生长型番鸭相比共有186个显著DEGs,其中49个表达量上调,137个表达量下调。这些DEGs主要富集在磷脂酰肌醇三激酶-丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路和腺苷酸激活蛋白激酶(AMPK)信号通路。【结论】PI3K-AKT、MAPK、AMPK这3条信号通路是控制番鸭机体生长发育的重要调节信号通路。

• 单位
  华南农业大学; 温氏食品集团股份有限公司