少汗性外胚层发育不良患者全外显子组测序分析

作者：柳星宇; 朱俊霞^*; 赵玉鸣

来源：中华口腔医学杂志, 2022, 57(02): 154-160.

• 外胚层发育不良, 少汗性, 常染色体隐性
• 外显子
• 突变
• 外异蛋白A基因
• 外异蛋白A受体基因
• 全外显子组测序

目的对少汗性外胚层发育不良(hypohidrotic ectodermal dysplasia, HED)患者进行基因突变检测及致病性分析, 为HED患者的基因诊断提供参考依据。方法收集2016年8月至2021年8月于北京大学口腔医学院·口腔医院儿童口腔科就诊的临床诊断为HED的患儿及其家系成员为研究对象, 对患儿及其家系成员行外周血基因组DNA提取, 利用全外显子组测序及Sanger测序检测基因突变, 进行罕见变异位点筛选, 并对筛选出的突变进行生物信息学功能预测。结果共收集到4例HED患者, 通过全外显子组测序检测并筛选出3个已报道过的外异蛋白A(ectodysplasin A, EDA)基因突变c.2T>C、c.161A>G、c.467G>A, 其中c.2T>C为起始密码子突变。此外还检测出1个未在HED病例中报道过的外异蛋白A受体(ectodysplasin A receptor, EDAR)基因突变c.871G>A。HED患儿及其家系成员的Sanger测序结果证明了上述突变的发生。上述突变的生物信息学功能预测结果显示, 本研究检测到的EDA基因突变均具有高度的物种保守性, 对EDA蛋白功能有害, c.2T>C、c.161A>G及c.467G>A 3种突变的联合注释依赖耗竭(combined annotation dependent depletion, CADD)数据库评分分值分别为22.5、26.3、25.5, 基因组进化速率评测(genomic evolutionary rate profilling, GERP)数据库评分分值分别为2.16、2.26、2.18。EDAR基因突变具有一定的物种保守性, 对EDAR蛋白质功能"可能有害", CADD评分分值为22.0, GERP评分分值为1.93。结论本研究在4个HED家系中检测出3种EDA基因突变和1种EDAR基因突变。EDA基因及EDAR基因上不同位点、不同类型的突变可对蛋白质功能产生影响, 导致HED的发生。

• 单位
  北京大学