奶牛隐性乳房炎抗性相关基因多态性与体细胞评分关联分析

作者：吴培; 赵宗胜^*; 何开兵^*; 朱梦婷; 南颖; 李增强; 邵焱焱; 方晨辉; 谢梦婷

来源：黑龙江畜牧兽医, 2023, (01): 68-77.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2022.03.0025

• 中国荷斯坦奶牛
• 隐性乳房炎
• 基因多态性
• 体细胞评分
• 多基因聚合分析

为了探讨中国荷斯坦奶牛隐性乳房炎相关基因NOD2c.4500、CXCR1+777、SPP1-1301、 TLR4+2021、CXCR2+777、 BRCA1c.46126单核苷酸多态性(SNPs)位点与体细胞评分的关联性，试验利用PCR-SSCP及Sanger测序技术对135头中国荷斯坦奶牛的6个SNPs位点进行基因分型，分析SNPs位点与中国荷斯坦奶牛体细胞评分的相关性，并运用多座位外显方差分析法(MPVA)对不同多基因聚合与奶牛体细胞数的相关性进行研究。结果表明：在6个SNPs位点上均检测到碱基突变，在NOD2c.4500 C>A、CXCR1+777 G>C、SPP1-1301 G>A、TLR4+2021 C>T位点上均检测到3种基因型，其中优势基因型分别为CA、CC、AA、CC,优势等位基因分别为A、G、A、C。在CXCR2+777 G>C、BRCA1c.46126 G>T位点上均检测到2种基因型，其中优势基因型均为GG,优势等位基因均为G。SPP1-1301 G>A、TLR4+2021 C>T位点均处于低度多态(PIC<0.25),其余位点则均处于中度多态(0.250.05)。CXCR2+777 G>C、TLR4+2021 C>T位点与体细胞评分的关联未达到显著差异(P>0.05);NOD2c.4500 C>A位点CA基因型、CXCR1+777 G>C位点CC基因型、SPP1-1301 G>A位点AA基因型、BRCA1c.46126 G>T位点GT基因型个体的体细胞评分显著低于其他基因型个体(P<0.05)。SPP1-1301-CXCR1+777-NOD2 c.4500为多基因聚合分析中最佳多座位组合，SPP1(AA)-CXCR1(CC)-NOD2(CA)为最佳基因型组合。说明SPP1-1301、CXCR1+777、NOD2c.4500位点与中国荷斯坦奶牛体细胞评分显著相关，可作为奶牛隐性乳房炎抗性基因的分子辅助标记。

• 单位
  石河子大学; 动物科技学院