基于高通量测序分析驴皮肤病病灶中细菌菌群组成

作者：樊坤; 伊艳杰; 刘阳; 王佳奇; 梁俊杰; 王子朝; 王雪琴; 白朋勋^*; 张慧茹^*

来源：动物医学进展, 2019, 40(06): 37-41.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2019.06.006

• 驴皮肤病
• 高通量测序
• 细菌菌群组成
• 高丰度菌群

驴皮具有极高的药用价值,但驴皮肤病临床发病率较高,不仅影响驴生长速度,也明显降低驴皮质量。驴皮肤病主要发生在头部和背部,临床表现为脱毛、皮屑、出血等。从天津某养殖基地采集不同症状的驴皮肤病样本37个,从中挑选6份典型皮肤病样品,采用高通量测序分析其细菌菌群组成,为研究其发病机制和防治提供基础资料。结果显示,在送检的6个样品中,发现存在4门、7纲、12目、19科、37属的细菌菌群。在属水平上,有Achromobacter、Stenotrophomonas、Pseudomonas为优势菌属,分别占总菌群的20.30%、15.00%和12.30%。通过PCoA和Venn图分析可知,皮肤出血、未出血病灶菌群组成明显不同;皮肤出血样品的菌群组成相似,Agrobacterium、Paenibacillus、Clostridium丰度较高;皮肤硬化菌群组成相似,Pantoea为主要菌群;多皮屑样品菌群组成有差异,Trichococcus是共有菌群。结果表明,引起驴皮肤病的细菌菌群组成具有明显差异,可为后期发病机制和防治提供科学依据。

• 单位
  天津市畜牧兽医研究所; 河南工业大学; 生物工程学院