日本的“里山”和“里湖”是自然与人化结合的产物，体现出生物同环境达到了统一的生态性，围绕此而展开的相关研究，显示了人与自然协同共生的层面。然而，由于彼时资源利用技术、不同人群生产与生活方式差异等因素的影响，也存在不同人群为获得利益与生存而争夺资源的激烈竞争与冲突，不排除人与动物争夺活动空间与栖息地，这些均应该成为日本环境史研究中以公害史为主流的重要组成部分，显示了日本环境史研究在学科属性上的独特性。
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