粪产碱杆菌DN25基因组分析与功能挖掘

作者：蒋汉语; 沈慧婷; 李青云; 唐爱星; 刘幽燕^*

来源：基因组学与应用生物学, 2022, Z1: 1893-1902.

DOI：10.13417/j.gab.041.001893

• 产碱杆菌属
• 全基因组测序
• 比较基因组学
• 基因功能挖掘

产碱杆菌属(Alcaligenes)是一类在环境污染修复领域应用较广泛的革兰氏染色阴性细菌。本研究以1株由课题组筛选获得的能降解氰化物、苯酚的粪产碱杆菌(A.faecalis)DN25为研究对象，通过全基因组测序分析，探讨该菌株的潜在功能。结果表明：DN25基因组大小为4 143 808 bp, GC占比为56.51%。通过COG、 GO和KEGG数据库对DN25基因组进行功能注释，共注释3 805个蛋白编码基因，发现DN25基因组以代谢功能基因为主，同时还拥有较多表达外界防御系统和自我调节系统的基因。通过与其他菌株基因组的比较，发现DN25与A.faecalis MUB14、A.faecalis P156、A.faecalis SCSIO.B001和A.faecalis ZD02都具有良好的共线性。本研究工作为后续深入开展产碱杆菌DN25生物催化功能研究提供了基因组信息和基因资源。

• 单位
  广西大学; 化学化工学院