筛选口腔扁平苔藓相关相关基因及生物学通路的研究

作者：隋长德^*; 夏萍; 齐春华

来源：实用口腔医学杂志, 2019, 35(02): 243-248.

• 口腔扁平苔藓(OLP)
• 生物信息学
• 蛋白质互作网络
• 生物学通路

目的:利用生物信息学方法识别口腔扁平苔藓(OLP)发病过程中的生物学通路及关键基因或分子。方法:从GEO数据库中下载GSE38616,通过t检验结合Benjamini-Hochberg校正的方法筛选差异表达基因,并根据差异表达基因构建蛋白质互作网络,利用Cytoscape进行网络中心(Hub)节点识别,最后对差异表达基因进行富集分析。对Hub节点基因在20例OLP患者和20例健康对照者外周血中的表达进行检测。结果:在OLP与健康对照组之间共有212个差异表达基因。在构建的蛋白质网络中,所识别的Hub节点为GNB2L1,其在OLP患者外周血的表达显著高于健康对照组(P<0.001)。富集分析结果显示,212差异表达基因富集的通路有29个。所富集的细胞生物学过程有:信号转导、免疫反应、细胞通讯,类固醇代谢、突触小泡转运等。结论:本研究所识别出来的29条通路及Hub节点GNB2L1可能在OLP发生发展中起到关键作用。

• 单位
  白城医学高等专科学校; 哈尔滨医科大学附属第二医院