基于数据挖掘分析人组织激肽释放酶家族在结直肠癌中的表达和预后研究

作者：郭佩; 何宁宁; 夏玉军^*

来源：癌症进展, 2021, 19(02): 149-177.

• 结直肠癌
• ONCOMINE数据库
• TCGA数据库
• 组织激肽释放酶

目的探讨人组织激肽释放酶家族(KLK)在结直肠癌中的表达及其对预后的影响。方法挖掘ONCOMINE数据库,对各种类型恶性肿瘤中人KLK基因的表达进行分析。挖掘TCGA数据库,分析人KLK基因在结直肠癌组织和正常结直肠组织中的表达情况,进一步挖掘TCGA数据库以及GSE39582系列数据,分析人KLK基因表达与结直肠癌预后的关系。通过定量逆转录聚合酶链反应分析临床样本中人KLK基因在结直肠癌组织和正常结直肠组织中的表达水平。通过挖掘STRING数据库,对KLK基因相关的蛋白质-蛋白质作用网络进行分析。结果 ONCOMINE数据库中,KLK6、KLK8、KLK10和KLK11基因在结直肠癌组织中具有高水平的表达。GSE39582系列数据中,结直肠癌组织中人KLK6、KLK7、KLK8、KLK10、KLK11和KLK12基因的表达水平均明显高于正常结直肠组织,差异均有统计学意义(P﹤0.01)。KLK6、KLK8、KLK10和KLK12基因低表达患者的预后分别优于上述基因高表达的患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。临床样本中,结直肠癌组织中KLK1基因的表达水平低于正常结直肠组织,KLK6、KLK7、KLK8、KLK10和KLK11基因的表达水平均高于正常结直肠组织,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。通过蛋白质-蛋白质作用网络分析发现,α-突触核蛋白(SNCA)、YY1关联因子2(YAF2)和α2-巨球蛋白样蛋白1(A2ML1)等10个蛋白与KLK6、KLK8和KLK10具有相互作用。结论 KLK6、KLK8和KLK10基因在结直肠癌组织中高表达,且与结直肠癌患者的预后有关。

• 单位
  烟台毓璜顶医院; 青岛大学; 基础医学院