摘要
利用生物信息学手段及转录组测序方法对大豆78个GRAS家族基因进行系统分析。染色体定位结果表明78个GRAS基因不均匀地分布在20条染色体上。通过系统进化分析将大豆GRAS家族分为11个亚族。基因结构和保守基序分布分析结果表明GRAS家族成员在进化上具有保守性,尤其是进化关系较近的成员多具有类似的基因结构和蛋白质结构。转录组数据及qRT-PCR结果显示,5个基因受盐胁迫诱导上调,5个基因受盐胁迫诱导下调,其中GmGRAS14、GmGRAS33和GmGRAS69在盐处理12 h时上调倍数最高,而GmGRAS17、GmGRAS54和GmGRAS57在盐处理12 h时表达量下调倍数最高,说明这些基因可能在大豆响应盐胁迫方面发挥重要功能。
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单位湖南科技学院; 生物工程学院