东莞市2015—2016年柯萨奇病毒A6型流行情况及特征分析

作者：李艳芬; 黄勇; 张莉萍; 陈永迪; 曾汉日

来源：中国热带医学, 2018, 18(02): 116-120.

DOI：10.13604/j.cnki.46-1064/r.2018.02.04

• 手足口病
• 柯萨奇病毒A6型(CVA6)
• 进化分析

目的研究东莞市2015—2016年手足口病(HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CVA6)的流行情况及基因特征。方法采用RT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行检测,CVA6阳性标本上送广东省疾病预防控制中心,进行病毒分离及鉴定,扩增并测定VP1基因序列。从GenBank中选取其他CVA6代表株进行参考比对,利用DNASTAR软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega4.0.2软件构建亲缘性进化树。结果在1 145份标本中检出CVA6阳性标本580份,阳性率为50.66%(580/1 145)。序列比对显示,20株CVA6分离株VP1基因之间核苷酸同源性为93.6%100.0%,氨基酸同源性为97.7%100.0%。东莞市CVA6分离株VP1与近年来全球各地流行株核苷酸和氨基酸的同源性分别为93.4%98.5%和97.0%99.7%,与CVA6原型株Gdula以及我国山东省1996年分离株核苷酸和氨基酸相似性仅为82.5%85.8%和94.1%96.4%。系统进化树分析显示,2015—2016年东莞地区CVA6与近年来流行于世界各地的CVA6分离株同源性较高,而与原型株进化距离较远。结论 2015—2016年东莞市HFMD病原以CVA6为主,流行株为近年来流行于全国各地的CVA6新变种。

• 单位
  东莞市疾病预防控制中心; 广东省疾病预防控制中心