蛇毒I型和Ⅱ型磷脂酶A_2基因密码使用的比较和分析

作者：淳于柳爽; 史晓雄; 陶廷婷; 梁宁生

来源：广西医科大学学报, 2013, (06): 840-843.

DOI：10.16190/j.cnki.45-1211/r.2013.06.059

• 磷脂酶A2基因
• 密码子
• 同义密码偏好性
• 蛇毒 phospholipase A2
• codon
• codon usage bias
• snake venom

目的:通过比较和分析蛇毒中I型和Ⅱ型磷脂酶A2(phospholipase A2,PLA2)基因编码的特点,了解蛇毒中两类PLA2分子生物学的信息。方法:从国际基因库中搜寻所有蛇毒PLA2基因信息(mRNA),对于符合研究条件的基因,利用CodonW分析软件和计算机进行分析,计算出两类PLA2的同义密码相对运用值(Relative Synonymous Codon Usage,RSCU),编码区鸟嘌呤/胞嘧啶(GC)含量和GC在三联体密码子中第3位置上所占的百分比(GC3S)含量,以及4种类型的碱基的含量。结果:眼镜蛇科I型PLA2和蝰蛇科Ⅱ型PLA2基因编码区GC含量明显不同,蝰蛇科Ⅱ型PL...

• 单位
  广西医科大学附属肿瘤医院