通过miRNA-TF-mRNA调控网络揭示儿童1型糖尿病的潜在生物标志物

作者：赵威; 魏广友^*

来源：齐齐哈尔医学院学报, 2023, 44(05): 401-406.

• 儿童
• 1型糖尿病
• GEO数据库
• miRNA-TF-mRNA
• 生物标志物

目的 通过miRNA-TF-mRNA调控网络来预测儿童1型糖尿病(T1D)的潜在生物标志物。方法 以基因表达综合数据库(GEO)的GSE33440数据集为基因表达阵列。利用R包微阵列数据线性模型(LIMMA)识别差异表达基因(DEG)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选最重要模块，共同基因(CGs)被确定为DEG和最重要模块中的基因的交叉点；对CGs进行GO、KEGG通路富集分析；通过miRNA-TF-mRNA调控网络预测潜在生物标志物。结果 识别出51个DEG和9个重要模块；筛选出了12个CGs; CGs富集在腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信号通路以及胰岛素受体底物2基因(IRS2);在miRNA-TF-mRNA调控网络中miR-499b-5p可靶向IRS2,通过AMPK信号通路调节儿童T1D。结论 研究揭示了miR-499b-5p/IRS2可能被视为儿童T1D的潜在治疗靶点。

• 单位
  安徽理工大学; 亳州市人民医院