基于ITS的贵州省30个树种的DNA条形码研究

作者:成宇; 蔡莎莎; 舒剑锋; 袁昊; 伍颖; 凃翠; 杨鹏; 赵财*
来源:山地农业生物学报, 2018, 37(06): 31-35.
DOI:10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2018.06.006

摘要

本文对贵州省19科26属30种林木树种植物ITS序列进行PCR扩增及测序,用MEGA 5. 0软件对序列进行比对分析序列信息,用最近距离法计算种内及种间遗传距离,通过邻接法构建系统发育树。结果表明,供试树种的DNA总长度为506~684 bp,其中平均G+C含量为64%,种内平均遗传距离为0. 013,种间平均遗传距离为0. 236;基于ITS序列构建的聚类树显示,对30种林木树种的鉴定成功率为83%,因此,推荐ITS序列作为林木树种DNA条形码的候选序列。

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