摘要
为筛选出适合广金钱草6-BA和PEG-6000胁迫下进行实时荧光定量PCR检测的内参基因,本研究以水、100 mg/L 6-BA、150 g/L PEG-6000灌根培养至成熟期的广金钱草叶片为实验材料,从转录组数据中选取组蛋白(histone)、甘油醛三磷酸脱氢(GAPDH)、肌动蛋白(Actin)、微管蛋白(TUB)、多聚泛素酶(UBQ)、延伸因子1α (EF-1α)、磷酸葡萄糖变位酶(PGM)、金属蛋白酶(MPS)、核糖基化因子(ARF) 9个候选内参基因,采用实时荧光定量PCR法,利用Delta CT、ge Norm、NormFinder和BestKeeper四种方法对9个候选内参基因的稳定性进行分析。结果表明,四种方法分析结果基本一致,在6-苄氨基嘌呤(6-BA)及PEG-6000胁迫下,表达稳定性最高的3个内参基因是EF-1α、PGM和ARF,选定EF-1α为内参基因测定16个差异基因的表达量,并与RNA-Sep结果相比较,差异趋势高度一致。EF-1α、PGM和ARF可作为6-BA和PEG-6000胁迫下广金钱草基因表达分析的内参基因。
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单位国家中医药管理局; 广东药科大学