DNA条形码识别 Ⅲ.媒介蚊类DNA条形码芯片的初步研究

作者：赵明; 谭玲; 莫帮辉; 刘伟; 王仕应; 曾晓茂

来源：中国媒介生物学及控制杂志, 2008, (02): 99-103.

• COⅠ基因
• DNA条形码
• DNA芯片
• 蚊虫

目的利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的医学媒介蚊类鉴定方法。方法以蚊科5属15种,共30个样本为研究材料,获取其DNA条形码信息(COⅠ基因片段序列),采用基因块motif技术,搜索15个样本的同源保守基因序列,制作虚拟DNA条形码芯片。虚拟电子杂交30个样本,应用软件Bio-Edit计算属、种及种内个体间的同一性,应用phylip3.66软件以最大简约法分别对杂交结果和原序列进行聚类分析比较。结果选择78个DNA片段制作一张虚拟DNA条形码芯片,计算属间的平均同一性为0.75,同一属内种间的平均同一性为0.84,种内个体间的平均同一性为0.98,聚类分析结果一致。结论研制的虚拟DNA芯片能够鉴定本研究中的15种蚊虫,利用DNA条形码信息,设计DNA芯片在理论上可行。

• 单位
  四川出入境检验检疫局; 中国科学院成都计算机应用研究所; 中国科学院成都生物研究所