应用生物信息学鉴定无功能型垂体瘤驱动基因及特效药物筛选

作者：彭羿达; 王新慧; 葛琳娜; 姜珊珊; 彭畅; 钟升; 金日华; 王毛雨^*

来源：脑与神经疾病杂志, 2019, 27(07): 442-450.

• 生物信息学应用
• 计算机科学
• 数据挖掘
• 肿瘤驱动基因
• 治疗药物

目的通过无功能型垂体瘤(NFPA)致病驱动基因的鉴定以及药物的筛选验证,为生物信息学在自然科学领域的应用提供思路。方法基于基因表达微阵列芯片数据进行差异表达基因的分析。采用富集度分析(GO分析)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析以及蛋白质互作用网络(PPI)关系构建的方法,探究差异表达基因富集的生物学功能,鉴定出NFPA核心驱动基因。同时采用CCK-8、克隆形成、体外划痕以及流式测细胞凋亡等实验方法验证药物药效。结果 CALM1、PRDM10和RIPK4是原代人垂体无功能腺瘤(NFPA)致病驱动基因,STO-609可以作为抗NFPA的潜在治疗药物。此外,NFPA很可能多方面与帕金森病密切相关。结论基于计算机技术,应用生物信息学方法可进行肿瘤驱动基因的筛选,依据核心基因能够进行治疗靶点的设计以及药物药效的验证。将生物信息学手段应用于生命科学领域的研究意义重大,且切实可行。

• 单位
  吉林大学