多数据库分析ARHGAP44在结直肠癌中的表达及临床意义

作者：姜小叶; 姜钟翔; 向丽莼; 吴焦; 陈雪诺; 姜政^*

来源：重庆医科大学学报, 2022, 47(01): 97-104.

DOI：10.13406/j.cnki.cyxb.002779

• 结直肠癌
• ARHGAP44
• 预后
• 免疫

目的:探讨多个数据集中结直肠组织的Rho GTP酶活化蛋白44(Rho GTPase activating protein 44,ARHGAP44)表达情况及其与结直肠癌临床病理特征和预后的关系。方法:利用基因表达汇编(the gene expression omnibus,GEO)及癌症和肿瘤基因表达图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据集汇总结直肠癌相关数据,分析ARHGAP44表达及其与结直肠癌临床病理学的关系,用Kaplan-Meier分析和Cox回归模型评价其预后价值。采用RT-qPCR方法检测临床样本中ARHGAP44基因表达情况,之后使用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测通路,并使用单样本基因集富集分析(single-sample gene-set enrichment analysis,ssGSEA)算法,计算ARHGAP44与免疫细胞浸润之间的关联。结果:在TCGA、GEO数据集及临床样本中,ARHGAP44表达在肿瘤中降低(P<0.001),且与T分期及TNM分期有关(P<0.05)。ARHGAP44的低表达是结直肠癌患者总体生存(overall survival,OS)的独立危险因素(HR=0.44,P=0.02)。GSEA结果显示,ARHGAP44高表达样本中富集了结直肠癌通路、Notch通路、T细胞受体、B细胞受体等基因集。ARHGAP44的表达与macrophages、T helper cells、肿瘤浸润淋巴细胞(tumorinfiltrating lymphocytes,TIL)和typeⅠIFNresponse等免疫信号成负相关(cor=-0.35、-0.37、-0.33、-0.35、-0.23、-0.32,P=0.008、0.006、0.027、0.021、0.041、0.021)。结论:ARHGAP44的表达在结直肠癌中被下调,可作为独立的预后生物标记物,且在肿瘤免疫学中具有潜在作用。

• 单位
  重庆医科大学附属第一医院