基于调控网络构建的食管鳞状细胞癌放疗抵抗核心miRNA/mRNA鉴定

作者：黄珊^*; 王亚利; 王中卫; 白明华; 郭亚; 马红兵

来源：山西医科大学学报, 2019, 50(11): 1492-1498.

DOI：10.13753/j.issn.1007-6611.2019.11.002

• 食管鳞状细胞癌
• 放疗抵抗
• microRNA调控网络
• TCGA
• 核心mRNA

目的基于食管鳞状细胞癌肿瘤组织RNA表达情况构建放疗抵抗miRNA-mRNA网络,鉴定并验证放疗抵抗核心miRNA及mRNA。方法癌症基因图谱(TCGA)数据库选取行放疗的食管鳞状细胞癌患者,R语言edgeR包对比获得放疗抵抗组肿瘤组织差异表达mRNA(DE mRNA)和miRNA(DE miRNA)。miRWalk 3. 0预测DE miRNA的靶mRNA,Cytoscape绘制放疗抵抗miRNA-mRNA调控网络。采用MMC法分析获得核心miRNA及mRNA,实时定量PCR在放射抵抗癌细胞中进行验证。结果共获得548个DE mRNA和5个DE miRNA,成功构建放疗抵抗miRNA-mRNA调控网络,分析后最终获得4个核心miRNA(miR-1293、miR-873、miR-375及miR-1468)和5个核心mRNA(ZDHHC22、IGFBP5、ADAM23、NTNG1和DCC)。细胞学验证显示miR-1293、miR-375、IGFBP5、ADAM23在食管鳞状细胞癌放疗抵抗细胞表达具有明显差异(P <0. 05)。结论该研究通过miRNA-mRNA调控网络构建,鉴定食管鳞状细胞癌放疗抵抗核心miRNA和mRNA,为逆转放疗抵抗提供潜在靶点。

• 单位
  西安交通大学第二附属医院