广东省人类免疫缺陷病毒-1 CRF07BC毒株-基因特征和原发耐药突变分析

作者：兰芸; 李凌华; 蔡晓莉; 胡凤玉; 唐小平; 李俊彬; 李丽雅; 蔡卫平^*

来源：中华传染病杂志, 2018, 36(02).

• HIV-1
• 流行病学,分子
• CRF07BC
• 耐药突变

目的了解广东省HIV-1 CRF07BC病毒株gag-pol基因的遗传变异特征。方法收集广州市第八人民医院2015年2月至9月78例CRF07BC基因亚型HIV感染者抗病毒治疗前血浆,提取病毒RNA,反转录套式PCR扩增并拼接获得病毒gag和pol区基因序列。对获得的序列进行进化树、基因离散率、核苷酸多态性、选择压力和变异特征分析。结果人群主要传播途径为同性传播(80.77%,63/78),gag-pol基因进化树分成两个亚簇,不同传播途径毒株没有完全成簇聚集。gag基因平均基因离散率及平均熵值均大于pol基因。gag基因的p17区和p6区的平均基因离散率及平均熵值均大于p24区;pol基因的pr区平均基因离散率及平均熵值均大于rt区。gag和pol基因的平均ds/dn值均>1。将GAG区共享序列与选取的我国常见HIV相关抗原表位(A2、A11、B39、B60两个、Cw1、Cw3、Cw8)比较,发现P17区CTL抗原表位突变多于P24区CTL抗原表位。表位保守率分别为26.92%、0、1.28%、0、96.15%、82.05%、84.62%和98.72%。对pol区基因序列进行HIV耐药性分析,耐药突变发生率为2.56%(2/78)。结论广东省CRF07BC毒株的gag和pol基因均发生突变。gag基因变异度大于pol基因,且gag基因的变异主要体现在p17和p6区;gag和pol基因均受负向选择压力;P17蛋白CTL抗原表位变异度大于P24蛋白抗原表位;耐药突变发生率低于警戒线,可以继续监测耐药毒株传播情况。

• 单位
  广州市第八人民医院