水稻泛素连接酶ARI基因家族的生物信息学分析

作者：吕冰; 方是珍; 陶依婷; 唐瑭; 王艺霖; 陈开; 陈洪晴; 陈云

来源：分子植物育种, 2022, 1-11.

• 水稻
• ARI基因家族
• 类RBR型蛋白
• 泛素连接酶
• 生物信息学分析

ARI (Ariadne)蛋白是一种RBR (RING between RING fingers)型泛素连接酶(E3)，其在动物的生长发育和免疫应答中起着重要作用，而在植物中的研究极少。本研究通过生物信息学方法对水稻中的ARI基因家族进行分析：OsARI基因家族的11个成员依据系统发生进化树可分为两个亚家族，亚家族Ⅰ还可进一步分成两个亚组，且不同亚组具有特异的保守基序；保守结构域分析表明，除了OsARI5-2只有两个IBR (in between RING)结构域外，OsARI蛋白都是类RBR型蛋白；顺式作用元件分析表明，OsARI基因与光信号途径、茉莉酸和脱落酸等植物激素应答途径以及低温和厌氧等非生物胁迫应答途径相关；基因本体注释分析揭示，OsARI蛋白可能作为一种泛素连接酶参与物质代谢和生物过程调控；基因表达分析表明，OsARI基因在水稻各器官中都有表达，且其表达可受到茉莉酸和脱落酸等激素信号调控；蛋白互作网络分析表明，OsARI蛋白可能参与非光化学淬灭和细胞生长调节等过程。本结果可为水稻ARI基因家族的功能研究提供思路。

• 单位
  淮阴师范学院; 生命科学学院; 扬州大学; 江苏省作物遗传生理重点实验室