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摘要
为深入挖掘掌叶大黄全长基因信息，本研究对掌叶大黄幼苗的根、叶混合样品进行全长转录组测序，并利用生物信息学方法进行基因注释与结构分析。共获得63 514条高质量Isoforms，平均长度为1 497.16 bp，其中共有59 505条基因被Nr、Swissprot、KOG及KEGG数据库注释。KOG功能比对共成功注释到25个功能大类，一般功能预测排在首位，为7 392条；KEGG注释分析发现15条参与掌叶大黄次生代谢的通路；共有381条Isoforms编码蒽醌合成通路的28个关键酶；MISA分析发现9 267个SSRs位点，其中三核苷酸数目最多，占比49.13%。同时预测得到63 365个CDS序列、2 213个转录因子以及2 071条LncRNAs。本研究首次使用三代测序技术对掌叶大黄进行全长转录组分析，以期为掌叶大黄生长发育、代谢调控及遗传多样性分析等研究提供基础。
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