基于《福建统计年鉴》2002—2020年数据,构建多元线性回归模型,探究福建省创新投入对出口贸易的影响,以及产业结构的调节效应。结果表明:创新投入增长率对下一期出口贸易具有正向影响;第二产业、第三产业均分别对创新投入与出口贸易间的关系具有正向调节效应;细分产业如工业、建筑业、批发和零售业、交通运输、仓储和邮政业均具有显著正向调节效应。依据实证结果,提出加大创新投入支持、完善创新政策制度、重视非制造业产业结构等建议。