摘要
[目的]本文旨在开发纤毛鹅观草特异的寡核苷酸(oligonucleotide, oligo)探针,进一步完善纤毛鹅观草染色体鉴定技术。[方法]利用前期选育的普通小麦-纤毛鹅观草异附加系DA2S~cL和DA6S~c,通过流式分拣和基因组二代测序获得纤毛鹅观草染色体6S~c和染色体臂2S~c长臂的基因组序列,利用Repeatexplorer2/TAREAN软件从中鉴定出卫星重复序列并设计成oligo探针,通过荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization, FISH)分析所开发oligo探针的应用价值。[结果]从6S~c和2S~cL基因组序列中共鉴定出11个卫星重复序列并开发成11个oligo探针,oligo-FISH结果表明,其中6个探针可以在纤毛鹅观草染色体上产生明显杂交信号,而在小麦染色体上未产生明显杂交信号,可用于特异鉴定小麦背景中的纤毛鹅观草染色体或片段。对1套普通小麦-纤毛鹅观草异附加系oligo-FISH分析发现,oligo-2S~cL-163和oligo-6S~c-111仅在S~c基因组染色体上产生明显信号,可作为纤毛鹅观草S~c组特异探针;将oligo-2S~cL-161和oligo-2S~cL-163组合,对1整套二体异附加系进行双色oligo-FISH,构建了纤毛鹅观草染色体的oligo-FISH核型。[结论]本研究提供了纤毛鹅观草重复序列组成的初步信息,开发的探针能特异鉴定纤毛鹅观草染色体,阐明纤毛鹅观草2个基因组的来源和分化,对推动纤毛鹅观草优异基因的转移和利用有重要意义。
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单位作物遗传与种质创新国家重点实验室; 南京农业大学