基于GBS技术的铁皮石斛种质群体遗传结构分析

作者:付曼曼; 吴超; 丁晓瑜; 林森洪; 黎侠; 郭方其*
来源:分子植物育种, 2022, 20(23): 7950-7959.
DOI:10.13271/j.mpb.020.007950

摘要

铁皮石斛是中国传统的名贵中药材,具有抗氧化、抗衰老、增强免疫力等功效。本研究旨在通过GBS技术探讨不同省份来源的铁皮石斛的群体遗传结构。以59份来自不同省份的铁皮石斛为材料提取DNA,构建文库,库检合格后上机测序,测序数据质量合格后进行酶切,然后基于石斛参考基因组进行单核苷酸多态性检测,分析其进化树、主成分及遗传结构。从59份铁皮石斛样本中获得有效数据51.442 G,高质量SNP位点为69 943个,进化树分析结果显示59份不同省份来源的铁皮石斛可被分为3组,来自云南的品种与浙江的品种亲缘关系较近,主成分分析和群体遗传结构分析结果与进化树结果相一致。本研究结果可为铁皮石斛种质资源的收集和保护提供依据,为挖掘优良种质及培育优良品种提供资源。

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