生物胺受体配基结合区域及其位点的预测

作者：郭志云; 张怀渝; 王月兰; 岳俊杰; 梁龙; 黄培堂

来源：生物物理学报, 2005, (02): 95-102.

• 生物胺受体
• 配基
• motif
• 生物信息学
• 功能 Amine receptor
• Ligand
• Motif
• Function
• Bioinformatics

生物胺受体被认为是一类重要的药物靶标,用生物信息学手段寻找它的配基结合位点并分析其功能,对于药物设计具有重要的指导意义。从整体上结合可变性、疏水性和保守性构建了受体的2D螺旋横切面模型,预测出其可能的配基结合区Ⅰ、Ⅱ,其中TM3、TM4以及TM7在配基结合中起关键作用,E-Ⅱ环也参与了配基结合这一过程,这是对以往普遍认为只有TM参与配基结合的延伸。从局部上寻找了生物胺受体及其子受体的motif,提出了父家族可变子家族保守motif概念,即父家族可变区中出现的子家族保守的motif。最后结合整体与局部分析结果分析了各motif的功能,预测了行使配基结合功能的motif及其相应位点,结果证明与突变...

• 单位
  四川农业大学; 病原微生物生物安全国家重点实验室; 军事医学科学院