基于高通量测序分析不同地区魔芋根际土壤细菌群落多样性

作者：雷高; 李珊珊; 李亮亮; 王佰涛; 杨文玲; 刘德海^*

来源：中国酿造, 2023, 42(11): 99-103.

• 高通量测序技术
• 魔芋
• 根际土壤
• 细菌
• 群落结构

以昆明、宁德、南阳3地区魔芋种植区域土壤为研究对象，使用Illumina Mi Seq高通量测序技术，对细菌16S r RNA的V3～V4可变区进行测序，探究魔芋不同地区魔芋根际土壤中细菌群落结构和多样性的差异。结果表明，3处魔芋根际土壤样品共得到383 726条有效序列，昆明、宁德、南阳样品分别得到2 452种、2 798种、2 906种操作分类单元（OTUs）。Chao1指数、Ace指数、Shannon指数分析结果显示，3处土壤样品中细菌物种丰富度和多样性存在显著差异（P<0.05）。在属水平上，3地区魔芋根际土壤中细菌种类存在差异。昆明土壤样品中优势菌属（相对丰度≥1%）有12个，其中热酸菌属（Acidothermus）和芽单胞菌属（Gemmatimonas）为其独有；宁德土壤样品中优势菌属有7个，其中微杆菌属（Microbacterium）为其特有；南阳土壤样品中优势菌属有8个，芽孢杆菌属（Bacillus）为其独有。表明不同地区魔芋根际土壤细菌优势菌属存在明显不同。

• 单位
  河南省科学院生物研究所