海南短指软珊瑚msh1基因的系统进化

作者:王潇仪; 吴阿宝; 李卫东*; 王沛政
来源:海南热带海洋学院学报, 2019, 26(05): 18-22.
DOI:10.13307/j.issn.2096-3122.2019.05.04

摘要

为了在分子水平上对海南短指软珊瑚进行分类与鉴定,以海南15份短指软珊瑚(Sinularia)与结合Genbank种搜索到的Sinularia种msh1基因序列进行系统进化树构建分析.结果在msh1碱基比对中发现,所有海南样品与澎湖指形软珊瑚(S. penghuensis)、西沙短指软珊瑚(S. notanda)和南海圆形短指软珊瑚(S. brassica)亲缘关系较远.在已知种中,可以得出西沙短指软珊瑚(S. notanda)种分化时间最早.样本S126 msh1和S. polydactyla序列相同,则为多型短指软珊瑚(S. polydactyla);样本S121 msh1和S. cruciata序列相同,则为台湾海域软珊瑚(S. cruciata);样本S088 msh1与S. verseveldti序列相同,则为S. verseveldti;样本S193 msh1与S. flexibilis序列相同,则为弱软短指软珊瑚(S. flexibilis);样本S035msh1与S. abrupta(JX991168. 1)序列相同,则为S. abrupta.样本S053 msh1和S. crassa与S. finitima亲缘关系相近;样本S010 msh1、S118 msh1、S168 msh1、S100 msh1、S031 msh1和S. abrubta(FJ621374. 1)与西沙短指软珊瑚(S. molesta)和思氏指形软珊瑚(S. slieringsi)亲缘关系最近,因此这些海南样本都为Sinularia. sp.

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