Mn2+对偏肿革裥菌3个锰过氧化物酶基因在转录水平上的调控

作者：池玉杰^*; 吴书景; 于存

来源：吉林农业大学学报, 2019, 41(05): 540-552.

DOI：10.13327/j.jjlau.2019.4508

• 锰过氧化物酶基因
• 生物信息学比对
• 锰离子
• 转录调控
• 荧光定量PCR

检测了不同浓度的Mn2+对偏肿革裥菌3个锰过氧化物酶(MnPs)基因Lg-mnp1、2、3在转录水平上的调控作用,为研究MnPs基因的表达调控机制奠定基础。用相关生物信息学方法对基因和蛋白序列进行比对与分析,用qPCR检测了在LNAS培养基内Mn2+4种不同浓度下(0,40,200,400μmol/L) 3个基因在转录水平上的相对表达量。结果表明:3个Lg-mnps在基因结构上不尽相同,既有较多的相似之处,也存在着差异。在外显子的长度和序列组成、内含子的位置上,Lg-mnp1与Lg-mnp2更一致,而Lg-mnp3与二者一些特征相似、一些不尽相同。系统发育分析表明,Lg-mnp1和Lg-mnp2比Lg-mnp3更接近。3个Lg-mnps基因在转录水平上都受不同浓度的Mn2+差异调控,在不同浓度的Mn2+和不同时间条件下的转录水平各不相同,Lg-mnp1的最高转录量是在11 d时200μmol/L Mn2+下,为0. 043; Lg-mnp2的转录变化曲线与Lg-mnp1相似,但最高转录量是在9 d时200μmol/L Mn2+下,为0. 929; Lg-mnp3与Lg-mnp1、2不尽相似,最高转录量是在11 d时40μmol/L Mn2+下,为0. 106。Lg-mnp2的转录水平5 d后几乎在所有浓度Mn2+条件下都远远高于Lg-mnp1和Lg-mnp3的转录水平。

• 单位
  贵州大学; 东北林业大学