基于MSAP技术的不同栽培生产区域宁夏枸杞DNA甲基化多态性分析

作者：张芳; 卢有媛; 尚尔鑫; 郭盛; 鲁学军; 任钢; 陈占平; 赵玉玲; 钱大玮; 段金廒^*

来源：中国中药杂志, 2022, 47(02): 392-402.

DOI：10.19540/j.cnki.cjcmm.20211023.102

• 宁夏枸杞
• DNA甲基化
• 甲基化敏感扩增多态性
• 表观遗传
• 生态因子

宁夏枸杞在我国不同栽培产区环境中,发生了明显的表观遗传变异和分化。为探讨我国不同栽培产区宁夏枸杞DNA甲基化水平和模式的差异及变化规律,该文利用荧光标记辅助的甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism, MSAP)技术,对我国主要栽培产区宁夏银川平原、内蒙古巴彦淖尔、甘肃靖远、甘肃玉门、青海德令哈、新疆精河的53份宁夏枸杞基因组DNA样品进行甲基化水平和多态性分析。该研究建立了适用于宁夏枸杞基因组甲基化分析的MSAP技术体系,共筛选出10对MSAP选择性扩增引物,在所有共扩增出的5′-CCGG-3′甲基化位点中,35.85%为全甲基化位点、39.88%为半甲基化位点,表现出丰富的表观遗传分化程度。化学计量分析显示,影响宁夏枸杞表观遗传特性的主要因素是生态环境因素,其次是栽培品种差异因素,降水量、气温、土壤酸碱度等是影响各产地DNA甲基化差异的主要生态因子。该研究有助于深入理解宁夏枸杞在不同生态环境的适应策略,为枸杞子的种质溯源和道地性评判提供新的研究思路与方法。

• 单位
  南京中医药大学; 宁夏医科大学