水杉核糖体蛋白基因MeGl-RPL10的克隆及生物信息学分析

作者：刘小红^*; 张咏祀; 张春艳; 文国琴; 何道文; 赵欢

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(09): 4067-4072.

DOI：10.13417/j.gab.039.004067

• 水杉(Metasequoia glyptostroboides)
• 核糖体蛋白
• 基因
• 生物信息学分析

水杉(Metasequoia glyptostroboides)是中国有名的杉科孑遗植物,但是在分子水平的研究极少。本研究以水杉原生种为植物材料,基于三代测序技术的全长转录组文库克隆了一个核糖本蛋白基因(MeGl-RPL10)。对该基因作进一步的生物信息学分析,结果表明:MeGl-RPL10基因的全长cDNA为972 bp,编码长度为222个氨基酸的核糖体蛋白L10;该蛋白的分子量为25 081.21 kD,等电点为10.30,总平均吸水值为-0.497;含有8个常见功能位点;二级结构包括4个螺旋区、9个折叠区和一些无规则卷曲区;三级结构分析的结果进一步证实MeGl-RPL10基因的编码蛋白为真核生物核糖体蛋白L10。本研究结果可为水杉及其它物种的核糖体蛋白基因的结构和功能研究提供参考。

• 单位
  生命科学学院; 西华师范大学