肾透明细胞癌中检查点激酶2(CHEK2)的转录组学分析

作者：陈博宏; 马磊; 任浩敏; 曾津; 吴大鹏; 陈炜

来源：现代泌尿外科杂志, 2022, 1-5.

• 检查点激酶2
• 肾透明细胞癌
• 预后
• 免疫浸润

目的 利用生物信息学方法分析检查点激酶2（CHEK2）在肾透明细胞癌（ccRCC）中的表达、病理特征及预后,并探寻其涉及的分子信号通路及生物学功能。方法 从TCGA数据库下载ccRCC的转录组数据、临床病理数据及生存数据。使用R语言中的“survminer”包获得CHEK2表达量的最佳截值点,将患者分为高、低表达组,并评估CHEK2表达量与临床病理特征之间的关系。使用Cox回归分析探讨CHEK2在ccRCC中对患者预后的预测能力。通过富集分析（GSVA）探讨不同CHEK2表达水平时细胞通路的变化,并进一步研究CHEK2与免疫细胞浸润、免疫检查点分子表达的相关性。结果 CHEK2在ccRCC中表达水平显著高于正常组织。CHEK2的高表达与患者更高的T分期显著相关（P＜0.01）。生存分析表明CHEK2高表达的患者总生存期比低表达者显著缩短（P＜0.001）。单因素及多因素Cox回归分析表明CHEK2是影响患者生存的独立危险因素（HR=1.950,95%CI:1.490～2.570,P＜0.001;HR=1.588,95%CI:1.185～2.127,P=0.002）。GSVA发现CHEK2参与的通路有近曲小管碳酸氢盐重吸收、丙酸盐代谢、柠檬烯和蒎烯降解、脂肪酸代谢、原发性免疫缺陷、系统性红斑狼疮、p53信号通路、同源重组、DNA复制及错配修复等。相关性分析表明CHEK2可能与多种免疫细胞在ccRCC肿瘤组织中的浸润增多及多种免疫检查点分子上调有关。结论 CHEK2在ccRCC的高表达是不良预后的独立预测因素,可能参与调控肿瘤免疫浸润的相关事件,有望成为ccRCC治疗的新靶标。

• 单位
  西安交通大学第一附属医院