除临床表现、病史、影像学外, 下呼吸道感染(LRTI)的诊断水平主要依赖于临床微生物学实验室病原学检测能力, 但常规培养耗时长, 显微镜检的敏感度低, PCR等分子生物学检测方案覆盖的病原类别有限。近年来宏基因组测序(mNGS)技术的应用提高了LRTI的诊断率, 从而也出现对常规微生物检测能力不重视的现象。本文对如何适当使用上述检测方法加以评述, 并建议在mNGS背景下, 进一步加强临床微生物检测能力的建设。