重庆辣椒上烟草轻型绿花叶病毒的分子检测及全基因组克隆分析

作者：吴根土; 徐霞; 陈思敏; 孙淼; 楚成茹; 李明骏; 青玲^*

来源：西南大学学报(自然科学版), 2019, 41(05): 1-7.

DOI：10.13718/j.cnki.xdzk.2019.05.001

• 辣椒
• 烟草轻型绿花叶病毒
• RT-PCR检测
• 全序列
• 系统进化分析

辣椒是重庆重要的经济作物,烟草轻型绿花叶病毒(Tobacco mild green mosaic virus, TMGMV)引起的病毒病对辣椒生产造成了严重影响.为明确TMGMV在重庆辣椒上的发生、分布情况及其基因组特征,从重庆北碚、石柱、潼南和九龙坡4个区县采集29份疑似病毒病样品进行了RT-PCR鉴定,通过分段扩增测序的方法拼接获得病毒基因组全序列并进行了系统进化分析.检测结果表明:29份样品中有9份检测到TMGMV,检出率为31.03%,其中石柱县的检出率最高,为60.00%.序列分析发现,重庆辣椒分离物TMGMV-TN29基因组全序列具有烟草花叶病毒属(Tobamovirus)病毒典型基因组结构特征,由6 356 nt构成.系统进化分析得出,该分离物与TMGMV厦门分离物Xiamen (JX534224)具有较近的亲缘关系,核苷酸序列相似性达到99.75%.

• 单位
  西南大学