铁死亡相关的LncRNAs在甲状腺癌中的预后价值及预后风险模型构建

作者：章静; 王黎明; 周金宝; 刘贺; 潘越; 朱峰^*

来源：现代生物医学进展, 2022, 22(02): 282-288.

DOI：10.13241/j.cnki.pmb.2022.02.016

• 甲状腺癌
• 铁死亡
• LncRNAs
• 生物信息学
• 预后
• 风险模型

目的：探讨铁死亡相关的长链非编码RNAs(LncRNAs)在甲状腺癌中的预后价值并构建预后风险模型。方法：从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载甲状腺癌的转录本数据和临床数据，铁死亡相关的基因数据集是从铁死亡数据库（http://www.zhounan.org/ferrdb/)下载的259个基因集。得到铁死亡相关LncRNAs，与患者临床信息合并后，通过单因素Cox回归分析和Kaplan-Meier生存分析两种方法得到与甲状腺癌预后相关的铁死亡LncRNAs，通过R的survival包构建COX模型以此来建立最佳预后风险模型并予以验证。结果：获得30个铁死亡相关的LncRNAs，多因素cox分析得到10个与甲状腺癌预后相关的铁死亡LncRNAs，包括AL136366.1、AL162231.2、CRNDE、AC004918.3、LINC02471、AC092279.1、AC046143.1、LINC02454、DOCK9-DT、AC008063.1。Kaplan-Meier生存分析表明高风险组预后较差。单因素和多因素Cox分析表明风险评分可以作为独立预后因子。KEGG通路富集分析发现，差异基因可能与嘧啶代谢、核苷酸切除修复、NOTCH＿信号通路等通路有关。结论：通过生物信息学方法筛选出10个与甲状腺癌预后的铁死亡相关LncRNAs，并成功构建预后风险模型。

• 单位
  南京医科大学